>> Trung tâm Vật lý lý thuyết

Hoạt động

Seminar

< | 2014 | 2013 | 2012 | 2011 | 2010 | 2009 | 2008 | 2007 | 2006 | 2005 | 2004 | >

Seminar Vật lý lý thuyết và Vật lý tính toán:
Tên báo cáoMolecular Dynamic simulation of proteins using GROMACS
Người trình bàyThs. Trần Thanh Thúy
Cơ quanViện Vật lý
NgàyThứ Ba, 23-04-2013
Giờ10:00AM
Địa điểmPhòng họp tầng 1, Viện Vật lý, 10 Đào Tấn, Ba Đình, Hà Nội
Tóm tắtMolecular dynamic simulation is very powerful tool in modern molecular modeling, enables us to understand structure, dynamics with extreme detail – literally on scales where motion of individual atoms can be tracked. Gromacs is a vigorous software to perform molecular dynamic simulations and energy minimization that respectively optimize structure and simulate the natural motion of biological systems. In the presentation, I will introduce molecular dynamic simulation with Gromacs and represent its application for investigating the dynamic phase transition of protein as well as constructing the free energy landscape, identifying the metastable states of peptides.